fossere

[Clarisa]

. E per la prima volta m'accorsi di come i muri e le torri fossero in rovina/
Почему essere в congiuntivo?

[pipistrello]

Для эмоционального выделения (come + congiuntivo используется вместо chе без congiuntivo)

[adorada]

А здесь не косвенный вопрос?..

[pipistrello]

А какой тут вопрос?
Сравним для примера:
E' la prima volta che mi accorgo che i muri sono in rovina.
E' la prima volta che mi accorgo di come i muri siano in rovina.
Второй вариант имеет эмоциональную окраску.