DictionaryForumContacts

 dao2812

link 9.12.2014 16:55 
Subject: parametric gene variables (статистика + биология) biol.
Statistical Methods: To assess statistical significance, the following three different and independent methods were used.
1) P-value.
Independent t-Test were used for parametric ""gene variables"" (both normality and equality of variance conditions were met); the Aspin-Welch unequal-variance test (AW) for gene variables that met the normality condition, but not the equality of variance condition; and the Mann-Whitney U test (MW) for the non-parametric gene variables, i.e., for those variables that i) the normality condition was not met or ii) the normality and the equality of variance conditions were not met.

ROC curve analysis was performed on all ""gene variables"" in order to assess their discriminating power with respect to the two groups

Спасибо!

 dao2812

link 9.12.2014 17:00 
параметрические переменные, связанные с геном?

 гарпия

link 9.12.2014 17:11 
переменные с геном не связаны
ген как переменная

 dao2812

link 9.12.2014 17:15 

All gene variables that fulfilled all three criteria of statistical significance and were included in the final list were investigated for the possibility of "multiple probes targeting that same gene variable".

In the event there were multiple probes (more than one) "targeting a given gene variable", all probes were assessed for statistical significance.
targeting a given gene variable- зонды, направленно связывающиеся с геном, как переменной? Что-то не звучит ....

 гарпия

link 9.12.2014 17:40 
у вас там есть list of control genes и наверное, есть и test genes или типа того, это и есть gene variable - разновидность гена (вариация).

То, что у вас связывается, связывается с конкретной разновидностью, а про переменную в данном случае и писать не надо, это в статистической части надо указывать).

 dao2812

link 9.12.2014 17:45 
У меня как раз в статистической части указано: All gene variables that fulfilled all three criteria of "statistical significance" and were included in the final list were investigated for the possibility of "multiple probes targeting that same "gene variable".

 гарпия

link 9.12.2014 18:18 
я щас вчиталась...
Probe там разве зонд? Зонд-это не то. Probe - проба, тест, молекула, кот. связывается и т.п.

по смыслу: все статистически значимые разновидности гена, включенные в список, были исследованы на предмет вероятного взаимодействия множественных (многочисленных) проб с той самой разновидностью гена.

 dao2812

link 9.12.2014 23:41 
какие пробы могут взаимодействовать с геном?

 dao2812

link 9.12.2014 23:47 
похоже что пробы.
Там встречается проба с номером ILMN_1791270 (это ген кадгерина)
http://www.nextprot.org/db/entry/NX_Q9Y6N8/identifiers

 гарпия

link 10.12.2014 0:14 
если у вас там DNA microarray , то лучше писать не просто зонд, а ДНК-зонд, а сразу же думается о ЖКТ ))

хотя я бы предпочла /фрагмент ДНК, использующийся для гибридизации/ или /ДНК-проба при гибридизации/

 

You need to be logged in to post in the forum

Get short URL | Photo