описание рез-тов вестерн-блоттинга biol.

[framboise]

Всем здравствуйте! Буду очень благодарна, если кто-то поможет с вот таким контекстом:

Concomitant Western blots showed intact MMP-8 enzyme (75-80 kDa band) and a smaller 40-55 kDa band. The former moved together with a purified neutrophil MMP-8 and the latter with the mesenchymal MMP-8.

Вопроса два:
1) Как понять moved together во 2-м предложении - это просто "двигаться вместе", или я неправильно понимаю? Или понимаю правильно, но есть другой устоявшийся русский перевод?
2) "a smaller 40-55 kDa band" в 1-м предложении - по-русски говорится просто "меньший бэнд", или есть какой-то менее калькированный вариант?

[OlgaAvdeeva]

*Полоса* - это обычный термин для электрофореза. Откуда бэнды-то?

[tumanov]

все бэнды от транслэйтинга, вестимо

[framboise]

Вот и замечательно, что "полоса". Для меня область новая (встретилась в моём тексте довольно мимолётно), так что "бэнды" взялись из нескольких руководств, прочитанных в интернете - но там, видимо, много калькирования.

Буду благодарна за советы про "move together".

[гарпия]

a smaller band: полоса соответствует белку меньшего размера ( с более низкой молекулярной массой)

[OlgaAvdeeva]

1. Не уверена, что "a smaller band: полоса соответствует белку меньшего размера". Может быть, просто более узкая полоса.
2. Про *move together* без контекста и картинок могу сказать следующее: похоже, что на дорожки геля параллельно наносили испытуемый образец, а также стандарты *purified neutrophil MMP-8* и *mesenchymal MMP-8*. После детектирования обнаружили, что положение указанных полос на дорожках испытуемого образца совпадает с положением соответствующих стандартов. Наверное, это позволило идентифицировать ту самую, меньшую полосу.

[гарпия]

я тоже засомневалась про более узкую полосу, но поскольку указан меньший kDa в сравнении с большим для MMP-8 enzyme, о кот. ничего не сказано про размер полосы, то больше склоняюсь к молекулярной массе

[OlgaAvdeeva]

По поводу бэндов: давно заметила, что специалисты-генетики, молекулярные биологи и т.п. привычно говорят на языке, на 80% состоящем из калек. Как-то задавала вопрос по терминам на форуме MOLBIOL, больше туда за терминами не хожу, только если ради понимания смысла.
Думаю, что причина этого - в отсутствии российских расходных материалов, тест-систем и приборов. Поскольку все это добро импортное, народ переходит на птичий язык.

[framboise]

гарпия, OlgaAvdeeva, спасибо вам огромное. Вот хотелось бы знать, имеется ли в виду более узкая полоса или полоса с меньшей молекулярной массой. К сожалению, у меня нет картинок или дополнительных данных, где это можно было бы посмотреть.

OlgaAvdeeva, о да. В моей области (тоже около-медико-биологической, но совсем другой) тоже все разговаривают по-русски кальками и заимствованиями - видимо, потому что всё оборудование (да и большинство научных статей) изначально англоязычное.

[OlgaAvdeeva]

Мне кажется, что про меньшую молекулярную массу не стали бы добавлять еще одно определение, ибо и так видно, что она меньше. А по структуре фразы похоже, что хотели сказать все-таки *a smaller band*.

[glomurka]

кмк, если приведены значения в кДа, то дополнительно называть какое из них меньше - излишество. Так что "более узкая полоса" +1

[glomurka]

хех, извините дубль :)

[framboise]

OlgaAvdeeva, glomurka, поняла вас. Логично :)

[гарпия]

посмотрите тут
http://static.abdserotec.com/Lit-pdfs/Brochures1/western-blotting.pdf
на странице 6 "Why Use a Western Blot?"
"A smaller than expected band could indicate that the protein has been cleaved or is degraded" и рисунок под ним.
Я думаю если была бы узкая/широкая полоса, то тут бы говорили об интенсивности имхо

[OlgaAvdeeva]

Посмотрела, да, может и так.

[glomurka]

>>"A smaller than expected band could indicate that the protein has been cleaved or is degraded" и рисунок под ним.

Вот, кстати, на рисунке там написано правильно (Lower molecular weight than expected...)
А по тексту в следующем предложении Conversely, when bands are seen at higher levels than expected... . Мне представляется, что речь о расстоянии от конца дорожки до полосы. Для ВММ оно больше, а для НММ - меньше, отсюда и "smaller".
Ну и вообще, там (в пдф-е) речь о расположении относительно expected уровня, а у аскера такого, вроде бы, не просматривается.

ЗЫ. однако, вариант "более узкая" тоже не вполне. Ширина полосы - мера интервала молекулярных масс, а у этого mesenchymal MMP-8 он как раз больше оказался.

[OlgaAvdeeva]

Да, если суть в относительном количестве белка с указанной ММ, правильнее говорить об интенсивности полосы.

[framboise]

glomurka. да, у меня ничего в тексте относительно ожидаемого уровня не говорится.

Спасибо всем за обсуждение насчёт ширины и интенсивности полос, мотаю на ус!