LC/SRM chromatogram, SRM transition chromat.

[paulz]

Уважаемые дамы и господа, особенно Brains, alch, неизменный серёга и другие знатоки химии!

Помогите с хромато-масс-спектрометрией. Что такое по-русски SRM transition?

Контекст: Figure 14 is the LC/SRM chromatogram of the m/z 473-(здесь должна быть стрелка)456 SRM transition for 9-aminominocycline in human serum. Это заявка PCT WO2006052717. Как переводится SRM, я разобрался, но как передать всю подпись к рисунку по-русски, для меня загадка.

И еще. Что такое на самом деле LC/SRM chromatogram? Мой вариант - "ЖХ-хроматограмма, полученная в режиме селективного мониторинга реакций".

Заранее благодарен.

[alch]

Получается примерно так (ИМХО, метод новый): ЖХ/МС хроматограмма, полученная с использованием метода селективного мониторинга реакций (SRM) [для] перехода [ф р а г м е н т а] m/z 473-(здесь должна быть стрелка)456 для 9-амино...
Я думаю, что если есть m/z, то это все-таки ЖХ/МС хроматограмма с использованием метода селективного мониторинга реакций (SRM), просто у них для краткости пишут LC/SRM.

Есть вот что: www.textronica.com/aplicate/lcms/lcq_application.htm - 27k -
Введение на рынок семейства масс-спектрометров Finnigan LCQ, обеспечило не только мощный инструмент для практического качественного анализа, но и высокочувствительного количественного анализа в сложных матрицах, значительно превышающего возможности традиционных одноквадрупольных систем. Фактически во время одного эксперимента масс-спектрометр записывает структурную информацию и, одновременно, обеспечивает количественный анализ с очень низкими пределами обнаружения. В сравнении с методом сочетания газовой хроматографии с масс-спектрометрией, недостаток сочетания жидкостной хроматографии с масс-спектрометрией с использованием ионизации при атмосферном давлении заключается в низкой эффективности разделения ЖХ. Поскольку большинство источников ионизации, работающих при атмосферном давлении генерируют одиночный псевдомолекулярный ион при отсутствии фрагментации, часто при большом уровне химического шума, возникает значительная неопределенность при интерпретации результатов. По этой причине метод селективного мониторинга реакций (SRM) стал наиболее часто используемым в фармацевтических и биотехнологических применениях метода ЖХ/МС. Благодаря высокой специфичности метода SRM достигается более низкий уровень химического шума и, соответственно, лучшие характеристики пределов обнаружения при количественном анализе.

[paulz]

Уважаемая alch, спасибо огромное. Спрошу еще по технической стороне предмета. Может быть, если Вы сами когда-либо работали с LC/MS-хроматограммами, у Вас есть мнение о том, что может отражать та хроматограмма, о которой идет речь? У меня его нет. Я вот чего не понимаю. То ли речь идет о реакции фрагментации исходного соединения в масс-спектрометре (в данном случае отщепления аминогруппы), то ли в SRM-методе регистрируются химические реакции, происходящие не в спектрометре? Тогда возможен вариант "переход исходного соединения (9-амино... и т.д.) с m/z=473 во фрагмент с m/z=456". Мне важно знать, относится ли подобная хроматограмма непосредственно к этому переходу и можно ли регистрировать хроматограммы отдельно для всех возможных переходов. В инете пока не нашел ничего подходящего.

[alch]

Я думаю, что у нас в РФ таких приборов скорее всего нет, а людей, которые на них работали, можно пересчитать на пальцах одной руки. Поэтому разбираться придется самим.
Из Вашей заявки:
[0125] Serum extracts were analyzed for tigecycline and selected metabolites by LC/MS/MS in the selected reaction monitoring (SRM) mode (LC/SRM) to reduce interference from endogenous components. These experiments were conducted with a dwell time setting of 200 ms. The following tigecycline related components were monitored.
А вот это мне было прочитать интересно и там сокращения, которые часто встречаются, расшфрованы http://www.textronica.com/basic/ms.htm
Из этого текста можно предположить, что фрагмент m/z 473 выделяют и потом еще раз подвергают дополнительной фрагментации - получается МС/МС. Но полной уверенности у меня нет и вряд ли кто-нибудь скажет точно. А картинка так какая - что там изображено, на этой фигуре?

[paulz]

Хороший хромато-масс-спектрометр есть в одной фирме, которая арендует помещения на нашем факультете. Они, скорее всего, знают терминологию, но не очень удобно к ним обращаться... Пожалуй, попробую. В любом случае спасибо.

[paulz]

На фигуре изображена хроматограмма с двумя основными пиками (исходного соединения и продукта) и 3 пиками меньшей интенсивности, остальное, видимо, шум. Скорее всего, фрагмент (9-аминоминоциклин) действительно выделяют.

[alch]

Я думаю, что ЖХ позволяет разделить продукты реакции на различных стадиях, отсюда это LC/SRM, а МС - их идентифицировать, причем для идентификации используют МС/МС, то есть для более точного анализа основной фрагмент подвергают дополнительной фрагментации, отсюда
МS/MS и transition. Вроде бы появляется ощущение уверенности в правильности такого подхода.

[paulz]

Уважаемая alch, я обратился к вышеупомянутому специалисту по LC/MS и, в частности, узнал, что SRM - все-таки не метод, а режим работы ЖХ/МС-спектрометра (если, он, разумеется, предусмотрен в приборе).

[paulz]

И спасибо за интересный обмен мнениями!